2026.3.27
病院の高額医療機器更新はいつ?融資・補助金・資金繰りの考え方
「高額医療機器は壊れてから買い替えればよいのか」
「今年のうちに入れた方がよいのか、来期に回した方がよいのか」
「借入、補助金、減価償却のどれを優先して考えるべきなのか」
病院の高額医療機器更新では、こうした悩みが必ず出てきます。CTやMRI、内視鏡システム、透析関連設備、手術機器の更新は、単に機械を買う話ではありません。更新後の収入見込み、保守費、故障時の止まり方、融資、補助金、減価償却、そして月次の資金繰りまで一体で見ないと、判断を誤りやすいテーマです。
結論からいうと、病院の高額医療機器は、「古くなったから買う」「利益が出そうだから買う」ではなく、収入・保守・資金繰りの3つがそろった時に買うのが基本です。とくに病院では、設備投資の判断がそのまま数年分の資金繰りに影響します。税務だけを見ても足りませんし、逆に価格だけ見ても足りません。
この記事では、病院が高額医療機器を更新するときに、何を順番に確認すべきかを整理します。WAM融資や補助金の考え方、保守契約と損害保険の使い分け、同一機種を複数台入れる場合の中古活用、減価償却とキャッシュフローの見方まで、実務に寄せて解説します。
高額医療機器の更新は、価格だけでなく、病院経営全体の数字で整理した方が安全です。 設備投資は、稼働率、保守、資金調達、返済までつながります。
「高額医療機器の更新を、病院経営全体の中で整理したい」という先生や事務長の方は、まず医療専門の税務顧問サービスをご覧ください。
- 病院の高額医療機器更新はいつ?
- 病院の高額医療機器更新で先に見るべき4つの数字
- 稼働率・紹介件数・1台あたり収入
- 故障率・停止時間・収入逸失
- 保守契約・スポット修理・機械補償保険の比較
- 人員配置・検査枠・建替え計画との整合
- 融資・補助金は「発注前」の段取りで決まる
- WAMが向く病院と、銀行借入が向く病院
- WAM融資で押さえておきたいポイント
- 補助金は「あるか」ではなく「目的に合うか」で見る
- 同一の医療機器を2台以上入れるなら、新品1台+中古1台も選択肢
- すべて新品でそろえないという考え方
- 具体例|新品2台ではなく、新品1台+中古1台にするケース
- 中古を入れるときに必ず確認したいこと
- 減価償却とキャッシュフローは分けて考える
- 減価償却は「使い始めた日」から始まる
- 具体例|3月決算の病院で、画像診断機器を更新するケース
- 簡易キャッシュフローは「税引後利益+減価償却費−借入返済元本+新規借入」で見る
- 具体例|利益は出ているのに現預金が減るケース
- 月次資金繰りは3か月先まで見ておくと安全
- 具体例|更新前後の月次資金繰りイメージ
- 病院の高額医療機器更新で「今年買う」「来期に回す」の分かれ目
- 今年買うべきケース
- 来期に回すべきケース
- 理事会で確認したいチェックリスト
- まとめ
- 病院の高額医療機器更新は、税務顧問と切り離さない方が安全です
病院の高額医療機器更新はいつ?

病院の高額医療機器更新でいちばん大切なのは、「いつ買えば資金が回るか」まで見て意思決定することです。判断の順番は、次の3つで考えると整理しやすくなります。
1つ目は、更新後に十分な収入が見込めるかです。
機械を入れ替えても、紹介件数や検査枠が増えず、予約待ちの解消にもつながらないなら、更新効果は薄くなります。まずは、稼働率、紹介件数、1台あたり収入、機会損失を数字で見ます。
2つ目は、保守と故障の持ち方が読めるかです。
機械本体の価格ばかり見ていると、更新後の保守費や故障対応費で想定以上に資金が出ていくことがあります。フル保守契約にするのか、定期点検中心でいくのか、突発的な修理は損害保険で持てるのかまで含めて考える必要があります。
3つ目は、借入と返済を含めても資金繰りが崩れないかです。
減価償却は費用ですが、現金支出そのものではありません。逆に、借入返済元本は費用ではありませんが、現金は減ります。病院の高額医療機器更新は、損益計算書だけでなく、現預金がどう増減するかまで見て判断するべきです。
年度末に慌てて更新を決めるのもおすすめしません。減価償却は支払日や契約日ではなく、実際に事業の用に供した日から始まります。融資も、制度によっては契約の順番を間違えると使えなくなります。設備投資は、年末に税金だけ見て決めるより、半年単位で段取りを組んだ方が安全です。
病院の高額医療機器更新で先に見るべき4つの数字
稼働率・紹介件数・1台あたり収入
まず見るべきは、機械の古さではなく、更新後に収入がどれだけ積み上がるかです。
CT、MRI、内視鏡システム、透析設備などは、単価の高い設備である一方、実際には「入れたのに思ったほど回らない」ということもあります。
確認したいのは、たとえば次のような数字です。
現在の稼働率
予約待ち日数
紹介元からの件数
検査や処置のキャンセル率
1台あたり収入
更新後に増やせる件数
大事なのは、機械の性能だけで判断しないことです。新型に入れ替えれば画質や処理速度は良くなっても、紹介元が増えない、医師や技師の体制が変わらない、検査枠が増やせない、という状況なら、収入は想定ほど伸びません。反対に、予約待ちが長く、紹介元の取りこぼしが起きている病院では、更新が収入改善に直結することがあります。
故障率・停止時間・収入逸失
更新判断では、「壊れた時にいくらかかるか」より、「止まると何を失うか」を見た方が実務的です。
修理代が高いことよりも、故障して検査や処置が止まり、紹介患者を受けられないことの方が痛いケースは少なくありません。
たとえば、次のような状況です。
故障の頻度が上がっている
メーカー部品の供給が不安定になっている
修理までの待ち時間が長くなっている
故障時に代替機がない
停止すると紹介元への影響が大きい
こうした状況なら、「まだ動く」ことと「まだ持たせるべき」ことは別です。病院では、停止時間そのものが収入逸失につながりますし、紹介元との関係にも影響します。更新時期は、修理代だけではなく、停止によって失う収入と信用まで含めて判断した方が安全です。
保守契約・スポット修理・機械補償保険の比較

高額医療機器更新では、買った後の保守をどう持つかも重要です。
ここを曖昧にすると、更新後に想定外の支出が増えやすくなります。
考え方としては、大きく次の3つがあります。
選択肢 | 考え方 |
|---|---|
フル保守契約 | 年間費用は高くなりやすいが、修理時の支出が読みやすい |
定期点検中心+都度修理 | 平時の固定費は抑えやすいが、大きな故障時に修理費が跳ねることがある |
定期点検中心+機械補償保険 | 点検は行いつつ、突発事故の修理費を保険でカバーする考え方 |
CTやMRIなど、保守点検が必要な医療機器では、保守点検計画の策定や記録が前提です。ですから、「保守契約を切る」か「続ける」かを価格だけで決めるのは危険です。まずは、法令や通知に沿った点検をどう実施するかを前提に、そのうえでフル保守にするのか、定期点検契約を厚めにするのか、修理は保険で持てるかを検討する流れが自然です。
実務では、フル保守契約を見直して、定期点検中心の契約に切り替え、突発的な事故による修理費を機械補償保険でカバーすることで、年間の固定費を抑えられるケースもあります。ただし、損害保険はあくまで不測かつ突発的な事故による修理費に備えるものです。定期点検や予防保守そのものの代わりにはなりません。
「保険に入るから保守は薄くしてよい」とは考えず、点検は点検、修理リスクは保険、という切り分けで見るのがおすすめです。
人員配置・検査枠・建替え計画との整合
高額医療機器は、機械だけ入れても動きません。
診療放射線技師、臨床工学技士、看護師、医師、事務の動線まで含めて、運用できる体制が必要です。
特に病院では、次を含めて考えた方がよいです。
新しい機械に合わせた人員配置が必要か
検査枠を本当に増やせるか
建替えや移転が近いか
病床再編や機能見直しが予定されているか
建替えや移転が近い病院では、今ここで買うより、建替え後にまとめて導入した方が効率的な場合もあります。反対に、建替えまで数年あり、その間に故障リスクが高いなら、つなぎでの更新や、中古導入を含めて検討した方がよいケースもあります。
4つの数字を見ても、「うちの病院では今年買うべきか、来期に回すべきか決めきれない」という先生や事務長の方は多いと思います。
高額医療機器の更新は、設置後の収入だけでなく、保守費や返済までつながります。
何を先に整理すべきか確認したい方は、無料の初回面談をご利用ください。

融資・補助金は「発注前」の段取りで決まる
WAMが向く病院と、銀行借入が向く病院
資金調達の選択肢として、まず思い浮かぶのは銀行借入だと思います。
一方で、病院ではWAMの融資も選択肢に入ります。ただし、WAMは誰でも使える汎用融資ではありません。
高額医療機器購入資金は、病院のみが対象で、一品5,000万円以上の医療機器が前提になる制度があります。さらに、民間金融機関が融資しない案件であること、収支悪化や赤字の要件、経営改善計画書の提出など、条件があります。
そのため、メインバンクで通常の設備資金を組める病院なら、まず銀行借入を軸に考える方が自然です。反対に、民間金融機関だけでは資金が組みにくい、あるいは条件が厳しい病院では、WAMが有力な選択肢になることがあります。
WAM融資で押さえておきたいポイント
WAMの高額医療機器購入資金では、融資限度額、無利子期間、返済期間などの条件があります。ここで大事なのは、条件の有利さだけではありません。資金調達の順番を間違えないことの方が大切です。
制度によっては、売買契約を先に締結してしまうと、後から融資対象にならないことがあります。
そのため、実務の順番は、基本的に次の流れで考えた方が安全です。
ベンダーから見積を取る
病院内で投資判断をする
融資や補助金を検討する
融資内定や補助見通しを確認する
契約に進む
ベンダーに急かされて先に契約してしまうと、使えるはずの資金調達手段が使えなくなることがあります。高額医療機器更新では、「何を買うか」以上に、「どの順番で動くか」が大切です。
補助金は「あるか」ではなく「目的に合うか」で見る
補助金も、設備更新では気になる論点です。
ただし、病院の高額医療機器更新では、「補助金があるから買う」ではなく、「自院の更新計画が補助の目的に合うか」で考える方が現実的です。
病院向けの補助は、汎用的な設備更新にそのまま使えるとは限りません。業務効率化、職場環境改善、へき地医療、遠隔医療、産科など、政策目的に紐づくことが多いです。
そのため、補助金を探すときは「何に使えるか」だけでなく、「その補助金は何を実現したい制度なのか」を見た方が、判断しやすくなります。
同一の医療機器を2台以上入れるなら、新品1台+中古1台も選択肢
すべて新品でそろえないという考え方
同一の医療機器を2台以上入れる場合、必ずしも全部を新品にする必要はありません。
たとえば、主力機は新品、バックアップ機やサブラインは中古、という組み方です。
この考え方が向くのは、たとえば次のような場面です。
主力機は止めたくないが、2台とも新品にすると資金負担が重い
建替えや移転までのつなぎとして使いたい
ピーク時間帯の検査枠を増やしたい
故障時の代替機を持ちたい
病院では、1台止まった時の影響が大きいので、「1台は新品、もう1台は中古」という選択肢は十分あり得ます。設備投資をゼロか100かで考えず、組み合わせで考えると動きやすくなることがあります。
具体例|新品2台ではなく、新品1台+中古1台にするケース
※以下は説明用の仮定例です。
比較項目 | 内容 |
|---|---|
新品2台のケース | 新品1台6,000万円×2台で、合計1億2,000万円 |
新品1台+中古1台のケース | 新品1台6,000万円+中古1台3,000万円〜4,000万円程度で、合計9,000万円〜1億円程度 |
差額のイメージ | 2,000万円〜3,000万円程度抑えられる可能性 |
中古価格は機種や年式、稼働時間でかなり差がありますが、病院実務では、バックアップ機や予備機の位置づけで中古を組み合わせることは十分に考えられます。
大切なのは、「中古が安いか」ではなく、「主力機として使うのか、補完機として使うのか」をはっきりさせることです。
中古を入れるときに必ず確認したいこと
中古導入を検討するなら、最低でも次は確認したいところです。
年式
稼働時間
故障歴
保守履歴
メーカー保守の可否
部品供給の見通し
設置費、搬入費、撤去費
更新後に想定する使用年数
主力機として使うのか、予備機として使うのか
加えて、税務上は中古資産の耐用年数も検討が必要になることがあります。新品と同じ前提でそのまま考えず、導入時点で税務・会計の整理をしておいた方が、あとで混乱しません。
減価償却とキャッシュフローは分けて考える
減価償却は「使い始めた日」から始まる
減価償却を考えるときに、まず押さえたいのは、支払日や契約日ではなく、実際に使い始めた日から償却が始まるということです。
高額医療機器では、年度末に契約や納品だけ済ませても、供用開始が翌期なら、その期の減価償却費にはならないことがあります。
具体例|3月決算の病院で、画像診断機器を更新するケース
※以下はわかりやすくするための概算例です。
項目 | 内容 |
|---|---|
決算月 | 3月 |
機器 | 画像診断機器(説明用に耐用年数6年で試算) |
取得価額 | 6,000万円 |
契約日 | 2026年3月10日 |
納品日 | 2026年3月28日 |
供用開始日 | 2026年4月10日 |
年間減価償却費 | 1,000万円(6,000万円÷6年) |
このとき、減価償却費の見え方は次のようになります。
見るポイント | 金額・考え方 |
|---|---|
2026年3月期の減価償却費 | 0円 |
2027年3月期の年間減価償却費 | 1,000万円 |
なぜ今期0円か | 3月に納品されても、使い始めたのが4月だから |
もし3月25日に供用開始していたら | 今期償却費は約83万円(1,000万円÷12か月) |
この例で大切なのは、「3月に契約した」「3月に支払った」ではなく、「いつ使い始めたか」で減価償却費が変わることです。
年度末に駆け込みで契約しても、供用開始が翌期なら、節税効果は今期には出ません。
簡易キャッシュフローは「税引後利益+減価償却費−借入返済元本+新規借入」で見る
設備投資を考えるときは、損益計算書だけでは足りません。
簡易的には、次の式で現預金の増減をつかむとわかりやすいです。
税引後利益+減価償却費−借入返済元本+新規借入 ≒ 簡易的な現預金増減
この式のポイントは、減価償却は費用だが現金は出ていない一方で、借入返済元本は費用ではないが現金は出ていくということです。
具体例|利益は出ているのに現預金が減るケース

※以下もわかりやすくするための概算例です。
項目 | 金額 |
|---|---|
税引後利益 | 4,000万円 |
減価償却費 | 8,000万円 |
借入返済元本 | 9,000万円 |
新規借入 | 3,000万円 |
設備投資の自己資金負担 | 3,000万円 |
補助金入金 | 翌期入金予定で今期は未入金 |
このケースを順番に見ると、次のようになります。
計算ステップ | 金額 |
|---|---|
税引後利益+減価償却費 | 1億2,000万円 |
そこから借入返済元本を差し引く | 3,000万円 |
そこに新規借入を加える | 6,000万円 |
簡易的な現預金増減 | +6,000万円 |
さらに設備投資の自己資金負担を差し引く | △7,000万円 |
今期の現預金増減イメージ | 1,000万円減 |
この例だと、利益は出ていますが、現預金は減っています。
理由は、借入返済元本と設備投資の自己資金負担が大きいからです。
つまり、理事会で設備更新を判断するときは、「利益が出ているから大丈夫」ではなく、「返済と投資を含めても現預金が持つか」まで見る必要があります。
月次資金繰りは3か月先まで見ておくと安全
高額医療機器更新では、年単位の損益だけでなく、月単位の現預金の動きを見ておくと事故が減ります。
特に、補助金の入金が後になるケースや、借入実行と支払日のタイミングがズレるケースでは、月次の資金繰り表が重要です。
具体例|更新前後の月次資金繰りイメージ
月 | 現預金に効く主な動き |
|---|---|
4月 | 頭金3,000万円を支払う |
5月 | 借入3,000万円が実行される |
6月 | 本体代金4,000万円を支払う |
7月 | 供用開始、減価償却はここから始まる |
8月 | 保守契約料300万円を支払う |
9月 | 補助金はまだ入金されない |
このように見ると、P/Lでは黒字でも、4月や6月の時点では現預金が大きく減ることがあります。
だからこそ、設備更新の判断では、少なくとも3か月先から半年先までの月次資金繰りを一度置いてみることが大切です。
月次で確認したいのは、次の項目です。
確認項目 | 見る理由 |
|---|---|
収入 | 更新後の回収力を確認するため |
人件費 | 検査枠増加で人員負担が変わるため |
材料費・消耗品費 | 更新後にランニングコストが増えるため |
保守費 | フル保守か、点検中心かで負担が変わるため |
保険料 | 機械補償保険を組み合わせる場合に必要なため |
借入返済元本 | 損益には出なくても現金が減るため |
新規借入 | 設備投資資金の補填額を確認するため |
補助金入金予定 | 入金時期が遅れると一時的に資金が苦しくなるため |
現預金残高 | 最終的に安全水準を維持できるか確認するため |
病院の高額医療機器更新で「今年買う」「来期に回す」の分かれ目
今年買うべきケース
今年買うべきなのは、たとえば次のようなケースです。
故障停止リスクが高い
メーカー保守や部品供給の終了が近い
稼働需要と収入見込みがある
紹介元からの件数増が読める
人員配置の目処がついている
融資や補助金の段取りが間に合う
建替えや移転までまだ期間がある
この場合は、先送りによる不利益の方が大きくなりやすいです。
「まだ動くから」ではなく、「止まった時に何を失うか」で見た方がよい場面です。
来期に回すべきケース
反対に、次のようなケースでは、来期に回した方がよいことがあります。
建替えや移転が近い
病床再編や診療機能の見直しが近い
人員確保の見通しが立たない
稼働見込みが弱い
ベンダー提案はあるが収入根拠が弱い
補助金や融資の段取りが間に合わない
今は新品1台より、中古併用の方が適している
高額医療機器更新では、「今買わない」という判断も立派な意思決定です。
焦って入れてから後悔するより、半年ずらして条件をそろえる方がよいケースは少なくありません。
理事会で確認したいチェックリスト
最後に、理事会や院内会議で最低限確認したい項目を挙げます。
更新目的は何か
収入見込みはあるか
稼働率はどう変わるか
故障停止リスクはどの程度か
保守契約はどうするか
保険で持てるリスクはどこまでか
新品か中古か、組み合わせの余地はあるか
発注予定日はいつか
融資申込はいつ動くか
補助金は目的に合うか
事業供用日はいつになるか
借入返済を含めた資金繰りに無理はないか
このチェックが曖昧なまま進めると、設備投資はうまくいきにくいです。
逆に、ここまで整理できていれば、買う判断も、見送る判断も、かなりぶれにくくなります。
まとめ
病院の高額医療機器更新では、機械の価格だけを見ても足りません。大切なのは、更新後に収入が見込めるか、保守と故障リスクをどう持つか、借入返済を含めても資金繰りが回るかです。
実務では、フル保守契約を続けるのか、定期点検中心にするのか、機械補償保険を組み合わせるのか、同一機種を複数台入れるなら1台は中古にするのか、という選択肢まで含めて考えます。
高額医療機器更新は、単なる「買い替え」ではなく、病院の数年分の資金配分を決める経営判断です。
とくに病院では、利益が出ているかだけでなく、税引後利益+減価償却費−借入返済元本+新規借入という視点で、簡易的な現預金の増減をつかんでおくことが大切です。減価償却は費用でも現金支出ではありませんし、借入返済元本は費用ではなくても現金を減らします。ここを混同すると、更新判断を誤りやすくなります。
病院の高額医療機器更新は、税務顧問と切り離さない方が安全です
病院の高額医療機器更新は、単に「今買うか、来年買うか」で終わるテーマではありません。
融資、補助金、保守契約、損害保険、中古機器の活用、減価償却、資金繰りまで一体で見なければ、正しい判断はしにくいテーマです。とくに病院では、設備投資の判断が、その後の月次資金繰りや返済計画にそのまま影響します。
私たち税理士法人シーガルは、開業医・医療法人専門の税理士法人です。医療専門の税務顧問サービスでは、代表税理士が直接担当し、医療法人設立、相続、医業承継にも対応しています。高額医療機器更新のように、税務だけでなく、融資や資金繰りまで絡むテーマは、単発のやり取りより、顧問レベルで継続的に見ていく方が安全です。
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この記事の監修者

税理士法人シーガル
代表社員/
税理士・公認会計士
中込 政博
あずさ監査法人・辻本郷税理士法人を経て、税理士法人シーガルを設立。税金に関する相談はもちろんのこと、公認会計士ですので、医業経営についてもぜひご相談ください!

税理士法人シーガル
代表社員/
税理士・行政書士
遠藤 大樹
医療特化会計事務所・税理士法人山田&パートナーズを経て、税理士法人シーガルを設立。医師・歯科医師に対する税務顧問の他、相続税申告や相続対策・医業承継もお任せください!
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